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卜德超  副研究員  

研究方向:

所屬部門:泛在計算系統研究中心

導師類別:碩導計算機應用技術

聯系方式:budechao@ict.ac.cn

個人網頁:https://scholar.google.com/citations?user=o-CZlyYAAAAJ

簡       歷:

20219月 — 今:中科院計算所,副研究員

20157月 — 20218月:中科院計算所,助理研究員

20097月 — 20156月:中科院計算所,碩博連讀

20059月 — 20096月:山東大學,本科生

主要論著:

期刊文章:

[1] Dechao Bu, Haitao Luo, Peipei Huo, Zhihao Wang, Shan Zhang, Zihao He, Yang Wu, Lianhe Zhao, Jingjia Liu, Jincheng Guo, Shuangsang Fang, Wanchen Cao, Lan Yi, Yi Zhao, Lei Kong.KOBAS-i: intelligent prioritization and exploratory visualization of biological functions for gene enrichment analysis. Nucleic Acids Research. Jul 2;49(W1):W317-W325. (IF=17SCI高被引論文)

[2] Junya Ning#, Yingnan Ye#, Dechao Bu#, Gang Zhao, Tianqiang Song, Pengpeng Liu, Wenwen Yu, Hailong Wang, Hui Li, Xiubao Ren, Guoguang Ying, Yi Zhao*, Jinpu Yu*.Imbalance of TGF-β1/BMP-7 pathways induced by M2-polarized macrophages promotes hepatocellular carcinoma aggressiveness. Molecular Therapy. Jun 2;29(6):2067-2087. (Cell子刊,共一作,IF=11)

[3] Yuwei Zhang#, Dechao Bu#, Peipei Huo, Zhihao Wang, Hao Rong, Yanguo Li, Jingjia Liu, Meng Ye, Yang Wu, Zheng Jiang, Qi Liao*, Yi Zhao*.ncFANs v2.0: an integrative platform for functional annotation of non-coding RNAs. Nucleic Acids Research. Jul 2;49(W1):W459-W468. (共一作,IF=17

[4] Dechao Bu#, Yan Xia#, JiaYuan Zhang#, Wanchen Cao1, Peipei Huo, Zhihao Wang, Zihao He, Linyi Ding, Yang Wu, Shan Zhang, Kai Gao, He Yu, Tiegang Liu, Xia Ding*, Xiaohong Gu*, Yi Zhao*.FangNet: Mining herb hidden knowledge from TCM clinical effective formulas using structure network algorithm. Computational and Structural Biotechnology Journal. Dec 4;19:62-71. (IF=7.3)

[5] Haitao Luo#Dechao Bu#Lijuan Shao#Yang LiLiang SunCe WangJing WangWei YangXiaofe iYangJun DongYi Zhao*Furong Li*. Single-cell Long Non-coding RNA Landscape of T Cells in Human Cancer Immunity. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2021 Jul 17:S1672-0229(21)00155-8. doi: 10.1016/j.gpb.2021.02.006. (IF=7.7)

[6] Dechao Bu#, Kuntao Yu#, Silong Sun, Chaoyong Xie, Geir Skogerb?, Ruoyu Miao, Hui Xiao, Qi Liao, Haitao Luo, Guoguang Zhao, Haitao Zhao, Zhiyong Liu, Changning Liu, Runsheng Chen, Yi Zhao.NONCODE v3.0: integrative annotation of long noncoding RNAs. Nucleic Acids Research. Jan;40(Database issue):D210-5. (IF=17SCI高被引論文)

[6] Haitao Luo#, Dechao Bu#, Liang Sun, Shuangsang Fang, Zhiyong Liu, Yi Zhao*.Identification and function annotation of long intervening noncoding RNAs. Briefings in Bioinformatics. Sep 1;18(5):789-797. (共一作,IF=11.6)

[7] Guoguang Zhao#, Dechao Bu#, Changning Liu, Jing Li, Jian Yang, Zhiyong Liu, Yi Zhao*, Runsheng Chen*. CloudLCA: finding the lowest common ancestor in metagenome analysis using cloud computing. Protein & Cell. Feb;3(2):148-52. (共一作,IF=15)?

專利:

[1] 趙屹,卜德超,周恒;高通量測序序列的存儲方法和查詢方法;2020ZL201710549780.9.

[2] 趙屹,卜德超,趙連鶴;一種基于二聯密碼子的測序數據壓縮方法;2019ZL201610380177.8.

科研項目:

國家自然科學基金青年基金:基于比較基因組學的長非編碼基因同源預測算法及序列結構和表達保守性研究, 課題負責人

獲獎及榮譽:

[1] 第一批國家中醫藥傳承創新團隊(全國10家)--中醫疫病學多學科交叉人才培養對象(全國9)

[2] 浙江省生物信息學會自然科學獎一等獎

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