中國科學院計算技術研究所創建于1956年，是中國第一個專門從事計算機科學技術綜合性研究的學術機構，致力于計算機科學技術領域的科學發現和技術創新，為我國經濟建設、國家安全和社會可持續發展不斷做出基礎性、戰略性、前瞻性的重大創新貢獻，努力成為社會公認的引領我國信息產業和信息化的計算技術主要源頭。研究所分為處理器、計算機系統、網絡、數據、智能五個研究部，下設十六個研究中心或實驗室。
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處理器研究部：
· 計算機體系結構國家重點實驗室：高端計算體系結構、微體系結構、編譯與編程、VLSI與容錯計算、非傳統體系結構；
· 微處理器研究中心：高性能處理器體系結構、IP及系統芯片（SoC）設計技術、低功耗處理器設計技術、處理器驗證與測試技術、納米級集成電路設計技術、高速信號傳輸技術；
· 智能處理器研究中心：智能算法共性特征分析、智能處理器體系結構、智能編程語言、分布式智能處理和智能芯片物理設計。
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計算機系統研究部：
· 高性能計算機研究中心：高性能計算機系統結構、系統軟件、高性能并行算法、高性能計算應用；
· 高通量計算機研究中心：可重構加速計算、高通量應用與并行算法，高通量眾核處理器，高通量計算機系統，超導計算機體系結構；
· 先進計算機系統研究中心：開源芯片及敏捷開發方法、軟件定義的云計算系統、異步消息式內存系統、一體化存儲系統、高性能高擴展數據中心網絡、數據中心測試標準和測試程序；
· 智能計算機研究中心：智能計算機構建的新原理和新結構、數據智能機和邊緣智能機等智能計算系統等。
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網絡研究部：
· 網絡技術研究中心：網絡體系結構基礎理論、組網關鍵技術、新型網絡設備與創新應用；
· 無線通信技術研究中心；以超級基站為核心、以基帶芯片和協議棧為支撐的無線通信領域的科學研究；
· 分布式系統研究中心：以推進信息高鐵試驗場建設為核心任務，研究分布式計算架構原理與方法、分布式系統軟件、協議和編程范式等。
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數據研究部：
·中國科學院網絡數據科學與技術重點實驗室：數據科學基礎理論、大數據分析技術、智能信息檢索、自然語言理解、開放知識計算、機器學習、分布式大數據系統和邊緣智能等；
· 數據智能系統研究中心：數據智能、社會計算、自然語言處理、網絡數據挖掘、智能金融、知識圖譜等；
· 專項技術研究中心；異構數據融合、網絡監控與安全、數字信號處理。
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智能研究部：
·中國科學院智能信息處理重點實驗室：圖像理解與智能人機接口、自然語言處理、多媒體、知識網格、數據挖掘、大規模知識處理、智能應用；
· 泛在計算系統研究中心：感知計算、人機交互、嵌入式系統、物端協同、傳感器網絡、物端計算系統、生物信息組學數據挖掘、計算機圖形學；
· 前瞻研究實驗室：跨媒體計算、虛擬現實、可視計算、人體運動仿真、算法與復雜性、生物信息學、智能農機等。
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計算所擁有計算機體系結構國家重點實驗室、大數據分析系統國家工程實驗室、中國科學院智能信息處理重點實驗室、中國科學院網絡數據科學與技術重點實驗室、移動計算與新型終端北京市重點實驗室。依托科研基地，計算所加強了原始創新研究、重大關鍵技術研究和產業化共性技術研究，以解決計算機學科中的重大科學和技術問題，為計算所的長遠發展提供長期的、戰略性的技術儲備和基礎，并培養一批高水平、高素質的學科帶頭人與學術團隊。
截至2024年底，計算所獲得國家、院、市、部級科技獎勵258項，其中，國家級科技獎勵55項（含非第一完成單位15項），院、市、部級科技獎勵203項（含非第一完成單位31項）。