簡 歷:
2010/07-至今,中國科學院計算技術研究所,前瞻研究實驗室,學術主任,研究員?
2006/05-2008/08,加拿大滑鐵盧大學,計算機系,訪問學者?
2003/07-2010/06,中國科學院計算技術研究所,前瞻研究實驗室,副研究員?
2001/01-2003/06,中國科學院計算技術研究所,前瞻研究實驗室,助理研究員?
1997/09 – 2001/01,中科院計算所,博士,導師:李國杰研究員?
1994/09 – 1997/06,中科院計算所,碩士,導師:白碩研究員?
1990/09 – 1994/06,山東大學,計算機系,學士?
主要論著:
期刊文章:?
[1]Chao Wang, Yi Wei, Lupeng Kong, Shiwei Sun, Wei-Mou Zheng, Dongbo Bu*,Constructing effective energy functions for protein structure prediction through broadening attraction-basin and reverse Monte Carlo sampling, BMC Bioinformatics, 2019?通訊作者?
[2]Jianwei Zhu, Sheng Wang, Dongbo Bu*, Jinbo Xu*,Protein threading using residue co-variation and deep learning, Bioinformatics, 2018, 34(13): i263~273 通訊作者?
[3]Jianwei Zhu, Haicang Zhang, Shuai Cheng Li, Chao Wang, Lupeng Kong, Shiwei Sun, Wei-Mou Zheng, Dongbo Bu*,Improving protein fold recognition by extracting fold-specific features from predicted residue–residue contacts, Bioinformatics, 2017 Dec, 33(53): 3749~3753 通訊作者?
[4]Hong Liu#, Maozhen Han#, Shuai Cheng Li, Guangming Tan, Shiwei Sun, Zhiqiang Hu, Pengshuo Yang Rui Wang, Yawen Liu, Feng Chen, Jianjun Peng, Hong Peng Hongxing Song, Yang Xia, Liqun Chu, Quan Zhou, Feng Guan, Jing Wu, Dongbo Bu*, Kang Ning*. Resilience of human gut microbial communities for the long stay with multiple dietary shifts, Gut 2018, DOI: 10.1136/gutjnl-2018-317298. 通訊作者?
[5]Shiwei Sun#, Chuncui Huang#, Yaojun Wang#, Yaming Liu, Jingwei Zhang, Jinyu Zhou, Feng Gao, Fei Yang, Runsheng, Chen, Barbara, Mulloy, Wengang Chai*, Yan Li*, Dongbo Bu*. Toward automated identification of glycan branching patterns using multistage mass spectrometry with intelligent precursor selection [J]. Analytical Chemistry, 2018, 90, 14412-14422. 通訊作者?
專利:?
[1]孫世偉,王耀君,卜東波,李巖,黃純翠,劉亞名,楊飛,武紅梅,陳潤生,多級質譜生物大分子結構鑒定方法,201510290301.7, 已授權?
科研項目:
[1] 國家自然科學基金面上,31770775,蛋白質殘基間相互作用預測算法研究及其在三級結構預測中的應用,60萬,在研,主持
[2] 國家自然科學基金面上,61272318,蛋白質結構模體識別及結構預測算法研究,2012/01-2016/12,80萬,已結題,主持?
[3] 國家自然科學基金青年基金,30800168,基于隨機圖的蛋白質三級結構預測研究,2008/01-2012/12,20萬,已結題,主持?
[4] 國家自然科學基金重大項目子課題,非規范知識處理的關鍵技術研究, 60496320,2005/01-2009/12, 120萬,已結題,子課題負責人?
卜東波 研究員
研究方向:
所屬部門:前瞻研究實驗室、處理器芯片重點實驗室
導師類別:博導計算機軟件與理論
聯系方式:dbu@ict.ac.cn
個人網頁:http://www.bioinfo.org.cn/~dbu/